代谢组学是对生物体或细胞在特定生理时期或条件下所有小分子代谢物进行定性定量分析的一门学科，其研究对象大多是分子量Da≤1000的小分子物质。代谢物处于生化活动终端，是基因表达与环境因素最终的表型体现。质谱检测是代谢组学检测的基本手段。目前代谢组学平台共有线性离子阱串联四极杆质谱联用仪2台及超高效液相色谱1台，并开放数据处理及组学数据分析软件。本平台的经典技术：分子量鉴定，小分子定性、定量分析，靶向代谢组学定量，代谢产物鉴定等；主流技术：非靶向亲水代谢组学，脂质组学，嘧啶组学，氧化应激组学，胆汁酸代谢通路，神经酰胺等代谢通路，色氨酸代谢通路，花生四烯酸通路等；特色技术：差分离子淌度分离同分异构体；可检测的样本种类：体液如血清、血浆、尿液、脑脊液、胆汁等；组织如心脏、肝脏、肾脏、肺脏、脑组织等；细胞如癌细胞、脂肪细胞、心肌细胞等代谢组学平台数据支持多篇论文发表在Nature、Science、Nature Metabolism、Cell Metabolism、Journal of Clinical Investigation、Analytical Chemistry等国际一流期刊上。